根据《招标投标法》第2条的规定，中华人民共和国境内的招标投标活动适用本法。根据逻辑推理，只要在中华人民共和国境内采用招标投标方法，即适用本法。当然，根据《招标投标法》第67条的例外情况，不包括在适用范围内。
根据法律咨询的情况描述，项目中标金额由486万元变更为357万元，并且业主要求招标代理机构退还多收的代理服务费。对于这样的情况，律师的解答是不合理的。
根据《招标投标法》第四十六条的规定，招标人和中标人应当按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再订立背离合同时执行内容的其他协议。因此，合同价款的变化属于招标人不按照招标文件和投标文件内容订立合同的违规行为。
招标代理机构有权按照招标文件和投标文件或招标代理合同的约定收取服务费。因此，招标代理机构不应退还多收的代理服务费。
《招标投标法》规定了招标代理机构的性质和条件，并明确了招标代理机构与招标人的关系。目前，招标代理机构面临以下主要问题：
满足水利工程项目招标要求的招标代理机构数量非常有限，无法满足需求。
现有的招标投标管理机构既从事对招投标活动进行监督的工作，又从事招标代理机构的工作。因此，必须立即将招标代理机构的工作与现有的招标投标管理机构分离出来，成立专门的招标代理机构，并给予支持，以满足《招标投标法》中规定的招标代理机构资格条件。
违反招标采购程序的处理方法，包括违反不同法规的不同情形及相应的处罚措施。对于招标文件的发售、澄清、修改时限不符合规定，接受应当拒收的投标文件等违规行为，将受到罚款、责令改正等处罚，并对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员进行处分。不同法规的罚款金
工程估算价为30万的项目招标方式。对于此类项目，可采用竞争性谈判、询价等方式进行招标，无需进行公开招标。规定指出，对于单项合同估算价低于规定标准或项目总投资额达到较高金额的情况可以不进行招标。
采购制度的规范化问题。包括采购原则、采购程序和采购人员的职责等内容。采购原则包括严格执行询议价程序、合同会签制度、职责分离等。采购程序涉及供应商的选择和审计、招标采购等。目的是确保采购活动的规范性和高效性，降低采购成本，提高采购质量，并保障企业利益。
虚假工程招标的认定及其相关问题。虚假招标包括围标、未发公告等手段，违反“三公”原则。招标过程中存在的内定标外陪标、制定招标文件偏袒、评标环节暗箱操作等都属于虚假招标的范畴。招标人若违规将被处以罚款，严重情况将追究刑事责任。虚假中标将被视为无效。
