工程纠纷超过三年不上诉就失效了。
在《合同法》中有说到，除了法律另规定的情形外，一般的合同纠纷诉讼时效期为三年，所以施工合同纠纷的诉讼时效期也是三年。
按照《民法通则》第137条中的规定得知，诉讼时效开始时间是从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。
所以当出现合同纠纷的时候，说明我们的权利已经被侵害了，这时就是诉讼有效期的开始时间，如果从此时起，超过了三年的时效期，那法律给予的保护将会失效了，我们也不能再提起诉讼。
建设工程施工合同纠纷案件当事人比较复杂。在处理该类案件中，较为常见的有以下六种情况：
1、因转包、违法分包合同发生纠纷，实际施工人只起诉承包人索要工程款的，应予准许，原则上不将发包人列为案件当事人。但承包人要求追加发包人为第三人并对其主张权利，而发包人对承包人又负有义务的，可以将发包人列为第三人;为了查明案件事实需要，法院也可以追加发包人为第三人;实际施工人直接以发包人为被告主张权利的，应予准许。
2、施工人挂靠其他建筑施工企业并以被挂靠单位名义签订建设工程施工合同，挂靠施工人或者被挂靠单位起诉发包人的，发包人可申请追加被挂靠单位或者挂靠施工人为第三人。发包人起诉挂靠施工人或者被挂靠单位的，可以追加被挂靠单位或挂靠施工人为共同被告。
3、转包、分包(包括违法分包)工程因工程质量引起的纠纷，如发包人只起诉承包人或者发包人只起诉实际施工人的，可依当事人的申请，将实际施工人或者承包人追加为共同被告。
4、承包人经发包人同意将工程转包的，属于合同转让即合同权利义务的概括转移。合同一经转让(转包)，承包人即退出承包合同关系，受让人(实际施工人)取得原合同当事人的法律地位，其起诉索要工程款，应当直接起诉发包人;与此相对应，发包人因工程质量问题应直接起诉实际施工人。
5、多个承包人联合共同承包的，因其均为承包合同的一方当事人，发包人提起诉讼的，承包各方应作为共同被告。
6、工程项目经理部不是适格的诉讼主体，应以设立该项目经理部的法人为诉讼主体。
工程转包纠纷问题的法律咨询。甲方作为建筑公司承包人，拖欠乙方工资引发纠纷。法院传票来时，甲方需仔细阅读传票内容并准备证据，可委托律师出庭应诉。同时，《中华人民共和国建筑法》规定建筑工程发包承包需订立书面合同，双方应全面履行合同义务，禁止收受贿赂和不正
债权人中断诉讼时效的方法，包括提出履行要求、请求保护民事权利以及报案或控告等方式，依据《民法总则》相关规定执行。中断情形包括权利人向义务人提出履行请求、提起诉讼或申请仲裁等，从中断开始或相关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算。
农村建房合同纠纷的案由定性争议。一种意见认为可以定性为建设工程施工合同，涉及合同效力、工程量计算、工程款支付、工程质量责任和违约责任等方面的不同法律效果。另一种意见则认为可以定性为承揽合同。根据具体情况和相关法律规定，法院将做出相应判决。
工程款纠纷的分类及预防和解决对策。包括发包方拖欠工程款违约纠纷、总包分包问题纠纷、竣工结算报告争议纠纷等七种类型。预防纠纷可从选择合作伙伴、审查建设手续、完善合同条款等方面入手。解决纠纷可通过双方协商、诉讼或仲裁等途径，针对不同类型采取不同解决方法。
