1、总分公司，如果均是独立核算的，能互相开票。总公司具有法人资格，而分公司不具有法人资格，但分公司能够以自己的名义从事民事活动，因此独立核算的总分公司能互相开票。
2、法律依据：
《公司法》第十四条规定，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。
《中华人民共和国民法典》第七十四条规定，法人可以依法设立分支机构。法律、行政法规规定分支机构应当登记的，依照其规定。分支机构以自己的名义从事民事活动，产生的民事责任由法人承担；也可以先以该分支机构管理的财产承担，不足以承担的，由法人承担。
分公司和总公司发票的处理方式：
1、如果是独立核算的，可以相互开发票，但需要按市场公允价格来计算，否则涉嫌关联交易；
2、如果不是独立核算的，而且又是在同一个区域内，或者经税务机关审批同意汇总缴纳的，可以汇总来汇算企业所得税；
3、其他处理方式。
设立分公司税务登记手续所需资料及流程。分公司需要提供营业执照、组织机构代码证书、地址证明、公司章程、法定代表人身份证明等文件，并将复印件粘贴在税务登记表相应位置，提交三份税务登记表。总公司还需提供成立分公司的决议等相关资料。分公司不具有企业法人资格，
总公司与分公司经营范围的关系，指出分公司经营范围可以与总公司不同，但不能超出总公司的经营范围。同时，文章还介绍了公司变更经营范围的法定程序、许可经营项目和一般经营项目的区分以及企业变更经营范围的申请和限制。
分公司与总公司之间的债务责任关系。分公司作为总公司的分支机构，虽具有一定的民事诉讼主体资格，但其民事责任能力有限。根据相关法律和司法解释，如果分公司的债务无法清偿，总公司需要承担连带清偿责任。最高院的复函也支持这一观点。
分公司的法律地位及其在兼并收购方面的限制。分公司是公司的附属机构，不具有法人资格，其设立需登记并领取营业执照，民事责任由总公司承担。由于分公司无法独立承担民事责任，因此不能兼并收购其他企业。子公司则具有法人资格，可独立承担民事责任。公司可以向其他企业
