１、当事人申请法院整体回避的，则应当就该案件更换法院进行管辖。根据《刑事诉讼法》的相关规定，上级人民法院可以指定下级人民法院审判管辖不明的案件，也可以指定下级人民法院将案件移送其他人民法院审判。
２、法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》
第二十六条几个同级人民法院都有权管辖的案件，由最初受理的人民法院审判。在必要的时候，可以移送主要犯罪地的人民法院审判。
第二十七条上级人民法院可以指定下级人民法院审判管辖不明的案件，也可以指定下级人民法院将案件移送其他人民法院审判。
第二十八条专门人民法院案件的管辖另行规定。
申请回避是诉讼当事人的诉讼权利，当事人对于审判人员、检察人员、侦查人员、书记员、翻译人员、鉴定人、勘验人等有权提出回避申请。
１、审判和执行人员的回避理由：
当事人及其法定代理人在诉讼中，发现审判人员（执行人员）具有下列情形之一的，有权要求他们回避：
（１）是本案的当事人或者与当事人有直系血亲、三代以内旁系血亲及姻亲关系的；
（２）本人或者其近亲属与本案有利害关系的；
（３）担任过本案的证人、鉴定人、勘验人、辩护人、诉讼代理人的；
（４）与本案的诉讼代理人、辩护人有夫妻、父母、子女或者同胞兄弟姐妹关系的；
（５）本人与本案当事人之间存在其他利害关系，可能影响案件公正处理的。
２、书记员、翻译人员、鉴定人、勘验人的回避理由：
当事人有权在下列情况下，对书记员、翻译人员、鉴定人、勘验人等用口头或者书面方式申请他们回避：
（１）是本案当事人或者当事人、诉讼代理人的近亲属；
（２）与本案有利害关系；
（３）与本案当事人有其他关系，可能影响对案件公正审理的。
法院工作人员违反规定不回避的处理办法，包括具体的处理措施和违反规定不回避的三种情形。根据《人民法院工作人员处分条例》，违反规定不回避可能导致警告、记过、记大过、降级、撤职和开除等处分。同时，文章还介绍了当事人如何申请回避的程序和注意事项。
关于回避申请的期限问题。根据《民事诉讼法》规定，人民法院应在当事人提出回避申请的三日内作出决定，可以是口头或书面形式。申请人对决定不满可申请复议一次，复议期间被申请回避人员仍可参与案件工作。法院对复议申请也应在三日内作出决定并通知申请人。
《民事诉讼法》中有关案件延期审理的时间限制。人民法院应在立案后六个月内审结，但可因特殊情况延长。延期需本院院长批准，且最长不超过六个月。延期开庭审理的情形包括当事人及其他诉讼参与人未能到庭、提出回避申请、需要补充调查等。
刑事诉讼中关于驳回申请回避的复议规定。其中涉及回避决定的形式和告知、当事人及其法定代理人的复议权利、最高人民法院的解释以及复议程序和时限等内容。文章明确了当事人对驳回回避申请的决定不服时，有权申请复议，并规定了复议的程序和时限，以保障当事人充分行使申
