在确定商业秘密侵权的损害赔偿额时，需要充分考虑以下因素：
商业秘密权利人因侵权行为遭受的损失主要包括可计算的财产和收入方面的损失。这包括：
可以根据销售量减少的数量乘以每件产品合理利润的乘积来计算。如果销售减少的总数难以计算，可以将侵权人的产品在市场上销售的总数乘以每件产品的合理利润的乘积作为损失的赔偿额。
如果无法确定权利人的损失或侵权人所获利润，可以参考商业秘密许可使用费或花费的合理费用来确定赔偿额。当商业秘密权利人与他人曾签订商业秘密许可合同时，可以根据许可费用来计算赔偿额。一般情况下，许可费用可以推定为赔偿数额，但在确定赔偿数额时，需要综合考虑侵权人的性质、情节以及商业秘密许可的性质、范围、时间等因素，在不低于许可费用至该许可使用费的3倍幅度内确定。法院还可以根据权利人的请求和具体案情，将权利人为调查、制止侵权行为、聘请律师费等支付的合理费用计入损害赔偿数额中。
定额赔偿是根据案件具体情况由法院酌情确定的赔偿额。当无法确定权利人的损失、侵权人获得的利益或商业秘密许可使用费时，可以采用定额赔偿的方法。根据相关规定，定额赔偿的金额一般在1万元至100万元之间，具体数额由法院根据侵权行为的性质、情节以及商业秘密的类型、评估价值、侵权持续时间和权利人因侵权所受到的商誉损害等因素综合考虑确定。
在确定商业秘密侵权的损害赔偿额时，一般按照以下先后顺序采用不同的方法：首先，以权利人的实际损失或推定损失为优先确定；其次，如果无法确定损失，可以参考侵权人的实际获利或商业秘密许可使用费来确定；如果上述两种方法均无法确定，可以考虑采用定额赔偿的方法，根据商业秘密的类型、侵权行为的性质和情节等因素确定赔偿额，以保护商业秘密权利人的合法权益。
除上述方法外，当事人也可以自愿协商确定赔偿额，只要不损害国家、社会或第三方的合法权益。
商业秘密侵权纠纷的处理方法，包括选择有利的管辖法院、全面收集证据、做好计算机软件侵权证据保全工作、寻找软件产品中的秘密点、重视司法鉴定程序和通过和解解决纠纷等方面。在商业秘密侵权案件中，需要采取相应的法律手段来保护自身权益，同时也应注重寻求双方利益的
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