根据相关法律规定，《中华人民共和国邮政法》第四十七条，包裹由快递员代签收的情况下，包裹丢失后责任分配如下：
1. 如果收件人同意由快递员代签收，则双方共同承担责任。
2. 对于保价的给据邮件丢失或全部损毁的情况，快递企业应按照保价额进行赔偿；对于部分损毁或内件短少的情况，应按照保价额与邮件全部价值的比例对实际损失进行赔偿。
3. 对于未保价的给据邮件丢失、损毁或内件短少的情况，快递企业应按照实际损失进行赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍；对于挂号信件丢失、损毁的情况，应按照所收取资费的三倍进行赔偿。
4. 快递企业应在营业场所的告示和提供给用户的给据邮件单据上，以足以引起用户注意的方式明确以上规定。
5. 如果快递企业因故意或重大过失造成给据邮件损失，或未履行以上规定义务，将无权援用本条第一款的规定来限制赔偿责任。
包裹代签收后丢失责任分配的问题。根据相关法律规定，如果收件人同意由快递员代签收，双方共同承担责任。快递企业对于丢失的包裹应按照保价额或实际损失进行赔偿，最高赔偿额不超过所收取资费的三倍。若快递企业故意或重大过失造成损失，将无权限制赔偿责任。
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