管辖权异议是指当事人对受诉法院或受移送案件的法院的管辖权提出异议的权利。当事人可以认为受诉法院对案件无管辖权，并向受诉法院提出不服管辖的意见或主张。而指定管辖是上级法院以裁定方式，指定下级法院对某一案件行使管辖权。
管辖权异议是指当事人认为受诉法院或受诉法院向其移送案件的法院对案件无管辖权时，而向受诉法院或受移送案件的法院提出的不服管辖的意见或主张。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十七条的规定，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。如果异议成立，法院将案件移送有管辖权的法院审理；如果异议不成立，法院将驳回异议。
指定管辖是指上级人民法院以裁定方式，指定下级人民法院对某一案件行使管辖权。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十七条的规定，有管辖权的人民法院由于特殊原因不能行使管辖权时，可以由上级人民法院指定管辖。特殊原因包括事实上和法律上的原因。指定管辖的决定由上级法院作出，下级法院应当按照指定管辖的决定进行审理。
在本案中，原告新疆某工程建设有限责任公司起诉被告十四师水利建管处拖欠工程款。原告认为十四师中级法院对本案有管辖权，但担心十四师政府部门的干涉，因此申请将本案指定其他兵团中级法院审理。
根据《中华人民共和国民事诉讼法》规定，管辖权异议申请是由被告提出的，只能针对一审案件提出，且必须在提交答辩状的法定期间提出。在本案中，原告作为一审原告主动向十四师中级法院提起诉讼，因此无权提出管辖权异议申请。
根据本案的情况，原告担心十四师中级法院在审理本案时会受到十四师政府部门的不当干涉，因此申请将本案指定其他兵团中级法院审理。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十七条的规定，有管辖权的人民法院由于特殊原因不能行使管辖权时，可以由上级人民法院指定管辖。在本案中，原告提出的指定管辖申请符合法律规定，应该由上级法院作出指定管辖的决定。
在受诉法院接到当事人请求指定管辖的申请后，应对其申请进行审查。如果申请符合法律规定，应写出书面请示，连同案卷材料一起送交上级法院，请求上级法院作出指定管辖的决定。如果上级法院作出指定管辖的决定，受诉法院应及时制作案件移送函，并将案卷材料连同指定管辖决定书一起移送至指定审理的法院。如果上级法院作出管辖决定由受诉法院审理，案件就只能由受诉法院审理。
然而，在本案中，十四师中级法院在处理原告的申请时，错误地以管辖权异议的规定作出裁定，导致上级法院发回重审。这表明办案人员对管辖权异议与指定管辖制度的规定理解不正确，需要进一步提高业务素质。
关于贪污案件是否由外地法院审理的问题。最高人民法院为确保公正审判，推出指定异地管辖制度，将职务犯罪案件指定到被告人任职地以外的省份进行异地审判。文章还介绍了异地管辖的原因、官员异地管辖的规定以及异地管辖法院的选择和特殊要求。
指定管辖案件的范围、申请指定管辖的情形及报送申请指定管辖材料的内容。指定管辖主要针对下级检察院之间就同一案件的管辖权发生争议或由于特殊原因无法行使管辖权的情况。申请指定管辖需向上级检察院提交相关材料，并说明具体情况和法律依据。
中国法律中关于管辖权的规定，包括级别管辖和地域管辖，以及移送管辖、指定管辖等特殊情况。当法院发现案件不属于本院管辖时，应移送有管辖权的人民法院；当事人对法院管辖权有异议的，应在规定时间内提出。上级法院有权在特殊情况下指定下级法院管辖。行政处罚法规定，
指定管辖的情形和级别管辖的规定。在管辖权不明确或有管辖权的法院无法行使管辖权时，上级法院可指定管辖。级别管辖方面，上级法院可审理下级法院管辖的一审刑事案件，且下级法院可请求移送。中级人民法院有管辖权处理特定一审行政案件，如商标、专利、海关等案件。
