为了实施对污染物排放行为的监督管理，控制环境污染，根据环境保护法律、法规，制定本条例。
本条例适用于直接或间接向环境排放污染物的法人、其他组织和个体经营者（以下简称排污者）。
国家对污染物排放行为的管理实行排污许可证制度。排污许可证为排放水污染物、大气污染物和环境噪声的综合排污许可证。
国家根据环境质量状况和社会、经济、技术条件，分阶段实施排污许可证制度。全国排污许可证分地区分阶段实施工作计划由国务院环境保护主管部门制定。
对实施重点污染物排放总量控制区域、流域、海域的排污者的总量控制要求，纳入排污许可证管理。
排污者排放污染物，应当向有审批权的环境保护主管部门申请领取排污许可证。
申请领取排污许可证，应当具备符合国家或地方环境保护法规和标准的污染防治设施，按照规定设置排污口，排放污染物达到国家或地方规定的污染物排放标准，有污染防治设施运行规程和运行维护方案，符合重点污染物排放总量控制要求，已安装污染物排放自动监控装置，有污染事故应急预案并配备相应设施和器材，依法缴纳排污费，有内部环境管理规章制度，以及国家环境保护主管部门规定的其他条件。
申请排污许可证，应当填报申请表，并提交符合条件的证明材料，包括环境保护设施竣工验收合格材料、排污口规范化整治验收合格材料、近一年内的环境监测报告、污染防治设施运行规程和运行维护方案、污染物排放自动监控装置的验收材料、污染事故应急预案和设施器材清单、排污申报登记材料、排污费缴款证明、内部环境管理规章制度，以及符合其他条件的证明材料。
排污许可证分级审批颁发。新建、改建、扩建项目和技术改造项目的排污许可证由负责其环境保护设施竣工验收的环境保护主管部门审批颁发。装机容量30万千瓦以上燃煤电厂的排污许可证由国务院环境保护主管部门审批颁发。省、自治区、直辖市环境保护主管部门确定的重点排污者的排污许可证由相应的环境保护主管部门审批颁发。设区的市级环境保护主管部门确定的重点排污者的排污许可证由设区的市级环境保护主管部门审批颁发。其他排污许可证由县级环境保护主管部门审批颁发。如果同一排污者需要由不同级别环境保护主管部门审批颁发排污许可证，由最高一级环境保护主管部门审批颁发。
国家环境保护主管部门会同发展与改革主管部门，编制全国重点污染物排放总量控制计划，确定实施排污总量控制的流域、区域和海域、重点污染物的种类及排放总量、需要削减的排污量及削减时限，以及装机容量30万千瓦以上燃煤电厂的二氧化硫排放总量控制指标。
县级以上地方人民政府根据全国重点污染物排放总量控制计划制定本辖区总量控制实施方案。实施方案应当确定需要控制和削减排污量的排污者、每一排污者排放重点污染物的种类及排放总量控制指标、需要削减的排污量以及削减时限要求。
环境保护主管部门应当在受理排污许可证申请之日起20日内，对申请者提交的申请材料进行审查，作出颁发或不予颁发排污许可证的决定，并告知申请者。
排污许可证正本包括排污者名称、住所、法定代表人，排放污染物的种类，有效期限，发证机关、发证日期和证书编号。副本还应包括排污者法人代码或业主身份证号码，法定代表人的姓名、电话、通讯地址，排污口的数量、编号、名称、位置，各排污口或噪声源排放污染物的种类、浓度、数量、速率、强度、方式、去向以及时段、季节要求，执行的污染物排放标准，有总量控制要求的污染物排放总量控制指标、削减数量及时限，对排放污染物的特别要求，年检记录和违章记录。
排污许可证持有人变更法人名称、住所和法定代表人和住所的，应当向原发证机关申请办理排污许可证变更手续。
排污许可证有效期限届满后需要继续排放污染物的，排污者应当在期限届满三十日前向原排污许可证颁发机关申请延续。
环境保护主管部门应当每年将上一年度排污许可证的管理工作情况报上一级环境保护主管部门备案。
各级环境保护主管部门应当建立、健全排污许可证的档案管理制度，并定期向社会公布审批颁发、年检、撤回、撤销、吊销排污许可证的情况。
县级以上环境保护主管部门应当通过书面核查和现场检查等方式，加强对排污许可证持有人的监督检查，并将监督检查情况和处理结果记录并归档。公众有权查阅环境保护主管部门的监督检查记录。
根据相关法律规定，持有排污许可证的单位应当如实反映情况，并提供必要的资料。检查机关在进行年检和现场检查时，应当保守技术秘密和业务秘密，不得索取或者收受被检查单位的财物或者谋取其他利益。
环境保护主管部门在年检和现场检查中发现排污许可证持有人不按许可证规定排放污染物的情况，有权采取证据保全措施，查封、扣押产生污染物的生产设备和相关物品。同时，环境保护主管部门可以责令减轻、消除污染，或者责令限制排污、停止排污。对于现场检查发现的情况，环境保护主管部门应当及时通知原排污许可证颁发机关。
在发生或者可能发生导致环境质量严重恶化的紧急情况时，县级以上环境保护主管部门应当采取应急措施，要求排污许可证持有人减少或者停止排放污染物，并立即将决定报告同级人民政府和原排污许可证颁发机关。紧急状态消除后，环境保护主管部门应当及时解除应急措施。如果应急措施直接影响公众生活、生产，环境保护行政主管部门应当及时公告采取和解除应急措施的决定。
在排污许可证有效期内，排污许可证持有人不再排放污染物，或者依法终止的，应当向原排污许可证颁发机关办理注销手续。如果出现排污许可证有效期限届满未申请延续、排污许可证被依法撤销、撤回或者依法被吊销等情形，原排污许可证颁发机关应当予以注销。
禁止无排污许可证或者不按照排污许可证规定排放污染物。同时，禁止涂改、倒卖、出租、出借及以其他非法形式转让排污许可证。
如果环境保护主管部门及其工作人员违反本条例规定，向不符合排污许可证申请条件的排污者颁发排污许可证、发现或接到举报未依法取得排污许可证的排污者擅自排放污染物不予查处、发现或接到举报排污许可证持有人不按照规定排放污染物不依法及时处理、索取或收受行政管理相对人财物或谋取其他利益、不依照环境法律法规的规定撤回、撤销或吊销排污者依本条例规定合法取得排污许可证等行为，其上级行政机关或监察机关应当责令改正，情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予降级或撤职的行政处分。如果构成犯罪，应当依法追究刑事责任。
如果环境保护主管部门不当颁发、撤回、撤销或吊销排污许可证，给被许可人的合法权益造成损害的，应当依法给予赔偿。
如果排污许可证持有人排放污染物的种类、浓度、数量、速率、强度超过许可证规定的，县级以上环境保护主管部门应当责令限期改正，并处1万元以上20万元以下罚款。如果超过许可证规定的浓度、数量50%以上，处1万元以上50万元以下罚款。如果逾期未改正，原排污许可证颁发机关可以收回排污许可证，换发临时排污许可证。如果处理机关与原排污许可证颁发机关不一致，处理机关应当将处理决定通知原排污许可证颁发机关，由原排污许可证颁发机关收回排污许可证，换发临时排污许可证。对于持有临时排污许可证的排污者，如果排放污染物的种类、浓度、数量、速率、强度超过临时许可证规定，或者临时排污许可证到期后仍不能达到临时排污许可证规定的治理目标，县级以上环境保护主管部门可以责令限产治理或者停产治理，并处1万元以上80万元以下罚款，可以由原颁发临时排污许可证的机关吊销临时排污许可证。对于数次违反规定，超过污染物排放标准或总量控制指标的排污者，按照其实际超过排放标准或总量控制指标的天数，按日加处1万元以上10万元以下罚款，造成或可能造成严重污染的，并吊销排污许可证、临时排污许可证。
违反本条例规定，无排污许可证排放污染物的，由县级以上环境保护主管部门责令限期停止排污，并处1万元以上100万元以下罚款；逾期继续排放污染物的，按日加处1万元以上20万元以下罚款；有违法所得的，没收违法所得；情节严重的，由工商行政管理部门依法吊销营业执照，并予以取缔。违反本条例规定，以欺骗、贿赂或其他不正当手段取得排污许可证的，由县级以上地方环境保护主管部门责令限期停止排污，处1万元以上50万元以下罚款，并由原排污许可证颁发机关撤销排污许可证；逾期继续排污的，按照本条例第三十七条的规定论处。情节严重的，三年内不予受理其排污许可证申请。违反本条例规定，伪造或涂改排污许可证的，按照本条例第三十八条的规定论处。违反本条例规定，倒卖、出租、出借排污许可证的，由原发证机关责令限期改正，处1万元以上10万元以下罚款，没收违法所得；情节严重的，可以吊销排污许可证。违反本条例规定，擅自改变排污口位置、增加排污口数量、增加有总量控制要求的污染物种类、改变污染物排放方式或去向的，或者不按照规定的时段、季节要求排放污染物的，由县级以上地方环境保护主管部门责令限期改正，并处1万元以上20万元以下罚款；逾期不改正的，可以由原排污许可证颁发机关撤销排污许可证，换发临时排污许可证；造成或可能造成严重污染的，可以吊销排污许可证。
妨碍、阻扰、或拒不执行环境保护主管部门作出的保全证据、限制排污、停止排污，或减轻、消除污染的强制措施，查封、扣押产生污染物的生产设备和相关物品的，应当责令改正；拒不改正的，可以依法申请人民法院强制执行。
如果排污者拒不执行环境保护主管部门作出的行政处罚决定，作出处罚决定的机关可以依法申请人民法院强制执行；情节严重构成犯罪的，依法追究刑事责任。
如果排污者认为环境保护主管部门在排污许可证的颁发和监督检查中做出的处罚决定侵犯其合法权益，可以依法申请复议；对复议决定不服的，可以依法向人民法院起诉。排污者也可以直接向人民法院起诉。如果期满不申请复议也不向人民法院起诉，又不履行处罚决定的，作出处罚决定的机关可以申请人民法院强制执行。
各省、自治区、直辖市、经济特区所在地的市和经国务院批准的较大的市，可以结合本行政区域实际情况，制定本条例的实施办法。
本条例施行前，已取得环境保护主管部门颁发的排污许可证，有效期届满前继续有效。未取得排污许可证的，应当自本条例施行之日起，60日内向环境保护主管部门申请领取排污许可证。逾期未申请的，按照无排污许可证排放污染物的情形予以处罚。
环境保护主管部门做出撤回、撤销或吊销排污许可证的决定时，应当通知工商行政管理、银行、证券、保险监督管理机关或其分支机构。
本条例自公布之日起施行。
地方政府在水环境保护方面的实质责任。文章指出，政府应将水环境保护纳入国家经济和社会发展规划，并承担相应责任。同时，企业需要遵守排放标准和总量控制指标，违规将承担法律责任。此外，重点实施了水污染物排放总量控制制度，并全面推行排污许可证制度以规范企业排污
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