公益诉讼的主体主要包括人民检察院、社会公益团体和个人。无论是自然人、社会组织、检察机关还是行政机关作为原告参与公益诉讼，都具有各自的优势和劣势。因此，建立一种互补的多元主体模式将更符合现实需求。每个人都是自己利益的最佳保护者，赋予公民公益诉讼起诉权是法律和社会发展的必然趋势。
人民检察院是中华人民共和国国家法律监督机关。作为国家公诉机关，代表公共利益提起诉讼是其本身的职责所在。在刑事诉讼中，检察院代表国家对犯罪嫌疑人提起诉讼以追究其刑事责任。作为政府的代言人，其主要目的是推动、维护和实现社会公共利益。
社会公益团体是指非政府的、不以利润最大化为首要目标，以社会公益事业为主要追求目标的社会组织和团体。市民社会需要通过在公共领域进行公共沟通才能够达成共识，不能由任何个人单方面宣称代表、限定或拥有决策权。因此，公益诉讼更多应该是一种动员、沟通和教育的方式，通过这些方式来实现公共利益。
个人，或称个体，一般指一个人或是一个群体中的特定主体。个人能够声称自己代表公共利益的事件是有限的，这种所谓的代表公共利益往往是个人主观认知的结果。
公益诉讼包括民事公益诉讼和行政公益诉讼，这是根据适用的诉讼法的性质或被诉对象的不同进行划分的。根据提起诉讼的主体，公益诉讼可以划分为检察机关提起的公益诉讼、其他社会团体和个人提起的公益诉讼。
(1) 法律规范的性质不同：民事公益诉讼维护的是民事法律规范，而行政公益诉讼维护的是行政法律规范。
(2) 被告的不同：行政公益诉讼以行政机关或其他公权机关为被告，而民事公益诉讼则以民事主体（或私人）为被告。
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