在企业厂房违建强拆过程中，可能会发生四类损失：房屋建筑本身、拆除后的剩余建筑材料、建筑厂房内的机器设备、原材料和产品等财产，以及停产停业造成的损失。在这种情况下，企业主需要考虑损失由谁承担。
如果厂房实际上并非违建，被拆迁的企业主可以通过行政复议及行政诉讼途径确认违建认定和拆除过程中的违法问题。如果能够确认违建认定和处理违法，那么被强拆的厂房建筑就是合法建筑，是被拆迁人的合法财产。
根据法律规定，公民的合法财产受到法律保护，如果被拆迁人的财产因相关行政部门的错误行政行为而受损，被拆迁人有权主张相应的损害赔偿（国家赔偿）。因此，包括厂房建筑被损毁、其他财产被毁坏以及因此遭受的停产停业损失都应得到赔偿或补偿。
如果被强拆的厂房确实是违建，那么厂房被拆除并无问题，被拆迁人应自行承担这部分损失。然而，根据相关法律规定，行政执法人员在对违法建设进行拆除时，无权对被拆迁人的其他财产进行任意处置，更不能因为拆除违法建设而损毁建筑内的财产。
在违建拆除过程中，相关行政部门应及时将建筑内的财产物品搬离，并对其进行保管、妥善安置、清点并交付给被拆迁人。如果强拆人员未将财产搬离即实施强拆，或搬离后未妥善安置保管相关财物，也未能为被拆迁人提供方便条件妥善处理相关财物，导致被拆迁人违法建筑之外的财产遭到损失，被拆迁人可以依据《国家赔偿法》等相关规定主张损失赔偿。
违建拆除的法律效果仅仅是建筑存续状态的灭失，拆除后的建筑材料仍为被拆迁人的合法财产，被拆迁人可以自行处置使用。
然而，被拆迁人需要注意的是，因拆除行为而导致的合理范围内的毁损通常应由被拆迁人自行承担。但如果被拆迁人的合法财产遭到不应有的损害，应当获得相应的赔偿。
如果被强拆的厂房确实是违法建筑，停产停业损失和设备搬迁费用并非拆除行为直接导致的损失，这部分损失一般由被拆迁企业自行承担。
在实践维权过程中，每个企业的具体情况不同，维权的切入点也会有所不同。但被拆迁企业主需要明确的是，无论被强拆的建筑厂房是否确为违建，其认定和处理都必须依据相关法律规定进行。同时，即使被强拆的厂房是违建，被拆迁人的其他财产权利也受到法律保护，不因厂房为违法建设而被忽视。
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