工程施工科目是建筑企业的生产成本科目，用于核算各项目的成本和毛利。在合同成本下，设置以下明细科目：
(1) 人工费（项目/部门核算）
(2) 材料费（项目/部门核算）
(3) 机械使用费（项目/部门核算）
(4) 其他直接费（项目/部门核算）
(5) 分包成本（项目/部门核算）
(6) 间接费用
间接费用下设以下明细科目：
- 管理人员工资（项目/部门核算）
- 职工福利费（项目/部门核算）
- 固定资产使用费（项目/部门核算）
- 低值易耗品摊销（项目/部门核算）
- 办公费（项目/部门核算）
- 差旅费（项目/部门核算）
- 财产保险费（项目/部门核算）
- 工程保修费（项目/部门核算）
- 排污费（项目/部门核算）
- 劳动保护费（项目/部门核算）
- 检验试验费（项目/部门核算）
- 外单位管理费（项目/部门核算）
- 材料整理及零星运费（项目/部门核算）
- 材料物资盘亏及毁损（项目/部门核算）
- 取暖费（项目/部门核算）
- 其他费用（项目/部门核算）
工程施工科目用于核算工程的毛利。具体设置根据企业需要选择，不一定非要设置这些会计科目。特别是间接费用，有些不需要的可以不予以设置。
机械作业科目主要针对建筑企业设备管理部门为各项目提供设备发生的费用及内部结算的台班进行核算。相当于制造业的辅助生产成本科目。有条件的单位可以针对公司设备设置单机核算，准确核算每台大型或主要设备每个台班的耗用成本。
通常情况下，应设置以下明细科目：
- 工资及附加（部门/设备核算）
- 燃料及动力（部门/设备核算）
- 折旧费（部门/设备核算）
- 配件及修理费（部门/设备核算）
- 间接费用（部门/设备核算）
1、应收工程款（往来单位核算）：根据工程进度报表或结算的应收账款进行核算。
2、应收销货款（往来单位核算）：核算施工企业应收产品销售货款。
3、应收质保金（往来单位核算）：根据合同及结算业主暂扣的工程质保金，最好设置有到期日。
1、应付购货款（往来单位核算）：核算应付购货款、设备款等。
2、应付分包款（往来单位核算）：核算应付分包工程款。
3、暂估应付款（往来单位核算）：核算暂估入账的款项（包括材料暂估入账及分包工程款的暂估入账）。
4、应付质保金（往来单位核算）：核算应付分包单位的质保金，最好设置有到期日。
根据业主进度报表签证资料或工程结算的款项进行核算。
手工账可不用以下明细科目，只需按项目设置明细科目即可。
目标成本下设置以下明细科目：
(1) 人工费（项目/部门核算）
(2) 材料费（项目/部门核算）
(3) 机械使用费（项目/部门核算）
(4) 其他直接费（项目/部门核算）
(5) 间接费用（项目/部门核算）
2、税金（项目/部门核算）
3、劳动保护费（项目/部门核算）
4、公司管理费（项目/部门核算）
5、公司利润（项目/部门核算）
其他会计科目的设置基本与其他行业的科目设置相差不大。
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