1、如果是员工擅自离职不对公司造成损失的，用人单位应当按照原工资标准及工作时间等计算工资，并于离职时支付或者在每月固定的时间支付。
2、如果造成损失的，可以扣减损失部分发放员工的工资。
3、法律依据：《工资支付暂行规定》
第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
(1)用人单位代扣代缴的个人所得税;
(2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;
(3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;
(4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
1、发出书面通知书：
（1）用人单位应当以书面形式送达通知书,限定员工在指定是时间内回公司上班；
（2）并提出如限期内不上班的处理措施。
2、作出辞退决定：
（1）当员工擅自离职达到可以辞退的标准时侯,用人单位应当将解除劳动关系的事宜公开；
（2）并以书面形式送达离职通知书给员工；
（3）通知员工前来办理交接工作以及离职手续。
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四川省疫情期间工资支付问题的法律解释。对于不同情况下员工工资的发放，包括因疫情不能提供正常劳动的员工、企业因疫情停工停产的员工以及因未及时返回企业复工的职工，都给出了具体的法律依据和解决方案。企业应当按照规定支付职工工资，并不得随意解除合同。同时，也
辞退补偿是否属于工资福利的问题。根据相关法律规定，支付给劳动者的经济补偿属于工资福利，可计入工资总额。工资总额包括多个部分，而不列入工资总额的范围则包括特定奖项、保险和福利费用等。辞退员工的补偿方式需经劳动合同当事人协商一致，根据工作年限支付经济补偿
疫情期间被隔离是否会扣工资的问题。根据《传染病防治法》的规定，政府实施隔离措施期间，被隔离人员的工作单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。同时，用人单位在疫情防控期间不得辞退被隔离的员工，疫情影响不计入职工的医疗期。
劳动者解除劳动合同的多种情形及相应的经济补偿金支付问题。劳动者可以解除合同的情形有17种，包括用人单位未提供劳动保护、拖欠工资等。用人单位可以解除或终止合同的情形有15种，如企业破产重整、生产经营困难等。无论哪方解除劳动合同，都应支付经济补偿金。
