船舶吨税的征收机关和纳税义务发生时间

根据《中华人民共和国船舶吨税法》规定，船舶吨税由海关负责征收。海关在征收吨税时，应当制发缴款凭证。

船舶吨税的纳税义务发生时间是指应税船舶进入境内港口的当日。

纳税期限

根据《中华人民共和国船舶吨税法》第八条规定，吨税纳税义务发生时间为应税船舶进入港口的当日。

对于吨税执照期满后尚未离开港口的应税船舶，应当申领新的吨税执照，并自上一次执照期满的次日起续缴吨税。

应税船舶负责人应当在海关填发吨税缴款凭证之日起的15日内，向指定银行缴清税款。

如果纳税人未按期缴清税款，自滞纳税款之日起，将按日加收滞纳税款0.5%的滞纳金。

多退少补

海关发现少征或者漏征税款的情况，应当在应税船舶应当缴纳税款之日起1年内，补征税款。

如果是应税船舶违反规定造成少征或者漏征税款的情况，海关可以在应当缴纳税款之日起3年内追征税款，并按日加征少征或者漏征税款0.5%的滞纳金。

海关发现多征税款的情况，应当立即通知应税船舶办理退还手续，并加算银行同期活期存款利息。

如果应税船舶发现多缴税款，可以在自缴纳税款之日起1年内以书面形式要求海关退还多缴的税款，并加算银行同期活期存款利息。

免征船舶吨税的情形

根据《中华人民共和国船舶吨税法》第九条规定，以下船舶可以免征吨税：

1. 应纳税额在人民币五十元以下的船舶；
2. 自境外以购买、受赠、继承等方式取得船舶所有权的初次进口到港的空载船舶；
3. 吨税执照期满后二十四小时内不上下客货的船舶；
4. 非机动船舶（不包括非机动驳船）；
5. 捕捞、养殖渔船；
6. 避难、防疫隔离、修理、改造、终止运营或者拆解，并不上下客货的船舶；
7. 军队、武装警察部队专用或者征用的船舶；
8. 警用船舶；
9. 依照法律规定应当予以免税的外国驻华使领馆、国际组织驻华代表机构及其有关人员的船舶；
10. 国务院规定的其他船舶。

第十项免税规定需由国务院报全国人民代表大会常务委员会备案。