根据我国《民事诉讼法》及最高院司法解释的规定，合同纠纷的管辖权由被告住所地或合同履行地的人民法院来行使。如果合同没有实际履行，当事人双方住所地又都不在合同约定的履行地的情况下，应由被告住所地的人民法院来行使管辖权。此外，根据法律规定，当事人在书面合同中可以协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地的人民法院来行使管辖权，但是协议不得违反民诉法对级别管辖和专属管辖的规定。
在股权转让协议纠纷中，如果双方当事人对管辖法院有约定且约定有效的，则应适用其约定；如果没有约定或约定不明确，则应适用法律规定，即由被告住所地或合同履行地的人民法院来行使管辖权。
在股权转让纠纷中，被告所在地一般不会有歧义。而对于股权转让的合同履行地，应为股权转让的目标公司的公司注册地。这是因为，公司股权转让纠纷的特殊性在于转让行为需要向公司注册地的登记机关履行相应手续方可完成。因此，以公司注册地作为此类案件的管辖地也是国际上通行的做法。
A公司与B公司于2013年底签订了一份《产权交易合同》，该合同规定了A公司向B公司（国有企业）受让目标公司股权的事项，包括股权数量、股权转让款金额、交易方式及违约责任等。同时，合同还约定了如果政府相关部门未能审批通过此次股权交易，B公司应在收到A公司书面通知后的3日内退还全部股权转让款。合同中对争议解决方式的约定为“双方依法向上海有管辖权的人民法院起诉”。
A公司住所地在上海市X区，B公司住所地在北京市，目标公司住所地在上海市Y区，产权交易所住所地为上海市X区。2014年初，A公司按照合同约定向产权交易所支付了全部股权转让款。然而，到了2014年8月，股权转让交易未获得政府相关部门的审批。A公司得知该消息后向B公司进行了及时通报。B公司在收到书面通知后的第30日向A公司全额无息返还了股权转让款。然而，A公司认为B公司迟延返还股权转让款的行为构成违约，因此拟提起诉讼。
2015年2月4日，《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》开始生效。
国家管辖权冲突的协调与避免纷争的问题。在管辖权发生冲突时，需要依据准据法来确定管辖，并符合受理、无管辖权和移送管辖三个条件。移送案件需满足不得随意移送的要求，移送后产生程序上的效力，由上级法院最终确定管辖权。
可以指定管辖的情形及规定。其中包括不属于本院管辖的案件、因特殊原因不能行使管辖权的情况、人民法院之间因管辖权发生争议的情形等。民法和刑法也有相应的指定管辖规定。在指定管辖时，需要遵循一定的程序和规定，如逐级报请、移送管辖等。最终，文章强调了指定管辖的
民事诉讼协议管辖的条件，包括合同案件的限定、法院选择范围的限定、书面合同的要求、单一选择的要求以及不得违反民事诉讼法规定。当事人协议管辖的案件仅限于合同案件，选择法院范围需符合规定，且必须以书面合同形式选择管辖，同时进行确定的、单一的选择，不得违反级
协议管辖的定义、法律依据以及适用范围。协议管辖是指双方当事人以协议方式选择解决纠纷的管辖法院，适用于合同纠纷和其他财产权益纠纷。法律依据为我国《民事诉讼法》第34条，当事人可书面协议选择与争议有实际联系的人民法院进行管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖
