1、员工不愿意签订劳动合同的，用人单位按以下方式处理：
(1)、用人单位可以要求劳动者签订劳动合同，签订劳动合同，对用人单位和劳动者都是保障;
(2)、如果经用人单位要求后，劳动者也不愿意签订的，用人单位可以解除劳动关系，否则用人单位就要承担责任。
2、法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第十条 【订立书面劳动合同】、第八十二条 【不订立书面劳动合同的法律责任】
在用人单位不与劳动者签订劳动合同的情况下，劳动者要想证明存在劳动关系可以采用下面几个证据：
(一)社会保险记录，社会保险缴费记录是证明存在劳动关系的一个强有力的证据;
(二)工资发放记录，如盖章的工资条、工资卡的银行记录;
(三)胸卡、门禁卡、工作证、工作卡或工作记录单(表);
(四)房贷收入、缴税证明，可以以买房买车贷款为由让公司开据收入证明;
(五)考勤卡，最好原件，且有公司的公章之类的;
(六)工资支付证明、拖欠工资的书面证明等，最好有原件;
(七)代表公司签署的商业合同、文件、以及授权书、出差的相应证据等，最好有原件;
(八)工作记录、出差的相应证据等，最好有原件;
(九)劳动监察部门投诉的记录;
(十)同事的证人证言，最好由在职的同事进行证明;
(十一)录音。
劳动合同期满时，用人单位不得解除劳动合同的多种情形，包括未进行职业健康检查的劳动者、患职业病或工伤丧失劳动能力的劳动者、患病或非因工负伤在医疗期内的劳动者、孕期、产期、哺乳期的女职工等。同时，劳动者违约离职需承担的责任和劳动合同到期不续签的经济补偿也
劳动合同纠纷中的反诉权，包括被告人是否可自行决定是否进行反诉，以及反诉和诉的合并的相关法律规定。同时，文章还详细列举了用人单位在解除劳动合同时无需支付补偿金的情形，包括劳动者试用期不符合录用条件、严重违反规章制度等。另外，也介绍了用人单位在特定情况下
根据我国《劳动合同法》第三十九条的规定，雇主可以解除劳动合同，而无需进行赔偿，当劳动者出现以下情况之一时：（一）在试用期间被证明不符合录用条件；（二）严重违反雇主的规章制度；（三）严重失职、营私舞弊，给雇主造成重大损害；（四）同时与其他雇主建立劳动关
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条规定，劳动合同终止时，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。具体情形包括：劳动者根据法律规定解除劳动合同；用人单位提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除；用人单位根据法律规定解除劳动合同；用人单位根据法律规定解除
