土地改变用途和协议出让是两个不同的概念，虽然它们都涉及到土地使用权的变更。土地改变用途是指国有土地使用权或集体土地使用权在初始登记后发生的变更，而协议出让是指国家以协议方式将国有土地使用权在一定年限内出让给土地使用者，并收取土地使用权出让金。
土地改变用途的程序包括以下两个步骤：
土地用途的改变会直接影响土地出让的最高年限和土地使用权出让金的变化。同时，土地用途的改变也会导致土地使用权出让合同中规定的权利义务关系发生变化。因此，在改变土地用途之前，必须获得出让方和城市规划行政主管部门的同意。城市规划行政主管部门的同意是必要的，因为土地用途是城市规划的重要组成部分，改变后的土地用途必须符合城市规划的要求。
土地用途的改变属于土地使用权出让合同内容的重大变更。因此，在取得出让方和城市规划行政主管部门的同意后，出让方和受让方应当签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同，以调整土地使用权出让年限，并相应地调整土地使用权出让金。
协议出让是指国家以协议方式将国有土地使用权在一定年限内出让给土地使用者，并收取土地使用权出让金的行为。协议出让是一种政府供地方式，与挂牌出让属于有偿出让的方式。土地使用者在以协议出让方式取得国有土地使用权后，必须严格按照规定的土地用途和条件使用土地。如果土地使用者需要改变土地使用权出让合同约定的土地用途，必须获得出让方和市、县人民政府城市规划主管部门的同意，并签订土地使用权出让合同变更协议或重新签订土地使用权出让合同，以调整土地使用权出让金。经批准改变协议出让土地用途后，应根据变更后的土地市场价格计算新的土地使用权出让金和原用途的土地使用权出让金的差额部分，作为补交的土地使用权出让金。
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