1、检察院收到羁押必要性审查申请后，按以下情形处理：
(1)办案机关对应的同级人民检察院负责控告申诉检察的部门或者负责案件管理的部门收到羁押必要性审查申请后，应当在当日移送本院负责捕诉的部门。
(2)其他人民检察院收到羁押必要性审查申请的，应当告知申请人向办案机关对应的同级人民检察院提出申请，或者在二日以内将申请材料移送办案机关对应的同级人民检察院，并告知申请人。
2、法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第五百八十一条
1、审查犯罪嫌疑人、被告人不需要继续羁押的理由和证明材料;
2、听取犯罪嫌疑人、被告人及其法定代理人、辩护人的意见;
3、听取被害人及其法定代理人、诉讼代理人的意见，了解是否达成和解协议;
4、听取现阶段办案机关的意见;
5、听取侦查监督部门或者公诉部门的意见;
6、调查核实犯罪嫌疑人、被告人的身体状况。
羁押必要性审查的缺点总结出以下几点：。在《刑事诉讼法》中并未提供有关羁押必要性审查权的监督问题的规定。《刑事诉讼法》第九十三条：“犯罪嫌疑人、被告人被逮捕后，人民检察院仍应当对羁押的必要性进行审查。对不需要继续羁押的，应当建议予以释放或者变更强制措施
羁押必要性审查按流程应由检察院受理，驻看守所检查室办理，一般5个工作日内，案件复杂的可再延长五个工作日，当做出变更强制措施决定后，交由案件承办公安机关领导批准，在十个工作日内做出决定。修改后的刑事诉讼法赋予了检察机关羁押必要性审查的职责。值得一提的是
经羁押必要性审查，发现犯罪嫌疑人、被告人具有下列情形之一，且具有悔罪表现，不予羁押不致发生社会危险性的，可以向办案机关提出释放或者变更强制措施的建议：。(七)与被害方依法自愿达成和解协议，且已经履行或者提供担保的;办理羁押必要性审查案件应当制作羁押必要
提升检察机关执法行为的公信力。应当建立羁押必要性说理制度，无论是继续羁押还是解除羁押，都应当将理由和依据对当事方进行必要解释，以获取各方的信赖和尊重，特别是不能忽视被害人权益的保障，对此可以建立捕后变更强制措施“被害人告知”制度。
