本案的争议焦点是关于郑某是否应当赔偿公司的培训费用。
郑某在仲裁审理中表示，他在公司从事的工作涉及到某公司的相关业务，而去某公司参加培训也是由该公司出资。因此，他不同意支付赔偿费用。
公司辩称，郑某在公司从事的是自动化方面的工作，2005年根据某国公司的邀请，公司派郑某去参加业务培训。根据双方签订的合同，如果在合同履行期间因个人原因离开公司，就需要支付赔偿费用。公司提供了一封信函作为证据，证明他们派郑某去某公司进行业务培训。
在庭审中，仲裁委员会查实了以下情况：郑某在2005年应某国公司的邀请，由公司派出参加业务培训，培训费用由对方出资。根据双方签订的合同，如果因个人原因在合同履行期间离开公司，就需要赔偿公司5万元。
然而，在庭审中，公司未能提供培训费用的单据。根据仲裁委员会的观察，根据相关法律规定，如果用人单位出资培训或提供其他特殊待遇，可以约定服务期。现在公司要求郑某赔偿，就需要提供出资培训的证据来确定赔偿金额。但是，由于公司无法提供培训费用的证据，仲裁委员会无法支持公司的要求。
根据相关法律规定，劳动合同当事人可以约定由用人单位出资招用、培训或提供其他特殊待遇的劳动者的服务期。同时，对违反服务期约定的可以设定违约金。换句话说，双方可以约定由单位出资培训的服务期，如果员工在服务期未履行完毕就解除合同，就需要支付约定的违约金。
在本案中，郑某的合同中约定了培训结束后需要为公司服务三年，并且在服务期内因个人原因离开公司，需要赔偿5万元经济损失。这份协议的原意可以理解为对未履行完毕服务期的赔偿，赔偿的性质应该被定性为违约金或培训费。然而，根据协议的书写定义，这笔费用被定性为经济损失，而不是违约金或培训费。
此外，如果这笔费用是公司出资培训所产生的，根据仲裁委员会的要求，公司应当提供出资培训的单据。然而，公司未能提供这些证据。因此，这笔费用的性质无法确定。如果这笔费用不符合法律规定，除非双方都同意，否则无法要求赔偿。在本案中，由于公司无法提供培训费用的证据，仲裁委员会无法支持公司要求郑某赔偿的请求。
根据劳动法的规定，公司应当非常清楚因培训而约定赔偿的性质。如果公司由于疏忽而导致了这样的结果，就需要承担相应的后果。因此，仲裁委员会无法支持公司要求郑某赔偿这笔费用的请求。
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